Perdóname, Señor serie gira en torno a una mujer llamada Lucía, una monja para nada convencional que tiene una personalidad fuerte.

Ella querrá regresar a su Barbate natal veinte años después de haber entregado a su hijo en adopción, el cual fue el fruto de un embarazo a una temprana edad. Siendo monja, ha logrado encontrar la paz que este hecho de su pasado le trajo a su vida. Sin embargo, se verá afectada por una crisis de vocación, y descubrirá una serie de mentiras que la llevaron a convertirse en una monja. A su vez, se reencontrará con los dos hombres más importantes de su vida; Rafa, su hijo que no sabe que esta monja es su verdadera madre y que ha iniciado una carrera como traficante de hachís, así como Bruno, el capo del narcotráfico en la zona, un chico con el cual tuvo una relación en la juventud y resulta ser el padre de Rafa. Cuando Lucía descubra a lo que se dedica su hijo, querrá luchar por apartarlo de ese mal camino sin verse afectada. Haga lo que haga, no podrá evitar que entre ella y Bruno vuelva a surgir el fuego, y esto la obligará a preguntarse qué camino es el más importante; si salvar a su hijo o darle una nueva oportunidad al amor.

Rafa en Perdóname, Señor serie descubrirá la verdad sobre su madre, pero no lo tomará bien.