Bon Appétit, Su Majestad sigue a Yeon Ji-yeong, una chef moderna que viaja inesperadamente en el tiempo a la dinastía Joseon durante un eclipse solar. Llega a la corte real del rey Yi Heon, un joven monarca agobiado por el trauma de la muerte de su madre y consumido por la venganza contra funcionarios corruptos. Confundida con una forastera desconfiada, Ji-yeong finalmente es nombrada chef de palacio tras impresionar a Yi Heon con su cocina innovadora, que combina técnicas modernas con ingredientes tradicionales. Mientras Ji-yeong se desenvuelve en la política palaciega, se enfrenta a la rivalidad de la concubina Kang Mok-ju y a las intrigas del príncipe Je Seon, quien planea derrocar el trono. A través de sus platos, Ji-yeong se gana gradualmente la confianza de Yi Heon y despierta recuerdos de la calidez y el confort de su infancia, desafiando su reputación de gobernante frío y tiránico. La serie entrelaza romance, comedia e intriga política mientras Ji-yeong lucha por sobrevivir, proteger a quienes la rodean y decidir si cambiar la historia o encontrar el camino de regreso al presente.